Nedaleký Dolní hřbitov, za jehož vznikem také stojí barokní architekt Jan Blažej Santini, je o něco starší než kostel, byl zbudovaný v roce 1709. Stejně jako kostel na Zelené hoře ho nechal zbudovat opat zdejšího cisterciáckého kláštera Václav Vejmluva. Potřeba nového hřbitova vzešla z hrozby morové epidemie. Původně měl tvar trojúhelníkový, další dvě zdi a čtvrtá kaple přibyly v roce 1755. 

Soutěžící se s Vodomilem podívají například do Žďáru na Zelenou horu.
Na Zelené hoře slaví. Poutní kostel ve Žďáře stojí už tři sta let

 Oslavy tří století kostela svatého Jana Nepomuckého na Zelené hoře vrcholí nyní o víkendu a také ve středu osmadvacátého září Lidovou krojovanou poutí. V sobotu se zde koná o půl páté mše svatá, v sedm hodin večer se pak uskuteční koncert světově unikátního chlapeckého sboru z Rakouska. Zpívat Budou na plovoucím pontonu na hladině Konvetního rybníka, v případě nepříznivého počasí v bazilice Nanebevzetí Panny Marie. Nedělní poutní mše se koná též v bazilice od devíti hodin, v kostele svatého Jana Nepomuckého bude od tří hodin odpoledne znalec české historie a umění profesor Ryot přednášet o ikonografii kostela i o samotném světci. V pět hodin rozezní kostel tišnovský komorní orchestr a pěvecký sbor. V úterý zde zazpívá od sedmi hodin večer Vocatus Ecumenicus, velké mužské pěvecké těleso z Jimramova.

Kostel svatého Jana Nepomuckého na Zelené hoře ve Žďáru nad Sázavou byl 23. října 2021 po generální opravě znovu požehnaný při mši..
Po roce ticha první mše: kostel na žďárské Zelené hoře je znovu požehnaný

Nedávno obnovená tradice, lidová krojová pouť ke svatému Janu Nepomuckému se bude ve Žďáře nad Sázavou konat i letos, a to ve středu 28. září. V deset hodin vyjde průvod z baziliky Nanebevzetí Panny Marie, za doprovodu dechové hudby se vydá ke kostelu na Zelené hoře. V jedenáct hodin začne poutní mše svatá s doprovodem lidových svatojánských písní v podání Horácké muziky. V poledne vystoupí v ambitech folklorní soubory a dětské pěvecké sbory. Ve čtyři hodiny odpoledne při pěveckém koncertu vystoupí Michaela Katráková a Martin Vydra. V šest hodin večer bude v zámecké čajovně přednáška o italském malíři.